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Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  49 lines
  1. ***************************
  2. * Transferrins signatures *
  3. ***************************
  4.  
  5. Transferrins are a family of eukaryotic iron-binding  glycoproteins that share
  6. the common function of controlling the level of free iron in biological fluids
  7. [1]. The transferrin family currently includes:
  8.  
  9.  - Blood serotransferrin (siderophilin).
  10.  - Milk lactotransferrin (lactoferrin).
  11.  - Egg white ovotransferrin (conalbumin).
  12.  - Membrane-associated melanotransferrin.
  13.  
  14. Transferrins are  proteins of 650 to 700  residues which have evolved from the
  15. duplication of a domain of around 340 residues. Each of the duplicated domains
  16. binds one atom of iron. Each iron atom is bound by four conserved residues: an
  17. aspartic acid,  two tyrosines, and a histidine [2].    All of the cysteines in
  18. both domains are involved in intradomain disulfide bonds.
  19.  
  20. We have developed three different signature patterns for transferrins. Each of
  21. them is centered  on one of  the  iron-binding residue,  respectively  the two
  22. tyrosines and the histidine.   Each of the signatures is present twice in each
  23. type of transferrins.
  24.  
  25. -Consensus pattern: Y-x(0,1)-[VAS]-V-[IVAC]-[IVA]-[IVA]-[RKH]-[RKS]-[GDENSA]
  26.                     [Y is an iron ligand]
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: guinea-pig sperm protein PH-20.
  29.  
  30. -Consensus pattern: Y-x-G-A-[FL]-[KRHNQ]-C-L-x(3,4)-G-[DENQ]-V-[GA]-[FYW]
  31.                     [Y is an iron ligand]
  32.                     [C is involved in a disulfide bond]
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Consensus pattern: [DENQ]-[YF]-x-[LY]-L-C-x-[DN]-x(5,8)-[LIV]-x(4,5)-C-x(2)-
  37.                     A-x(4)-[HQR]-x-[LIVMFYW]-[LIVM]
  38.                     [H is an iron ligand]
  39.                     [The two C's are linked by a disulfide bond]
  40. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  41. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  42.  
  43. -Last update: June 1994 / Patterns and text revised.
  44.  
  45. [ 1] Crichton R.R., Charloteaux-Wauters M.
  46.      Eur. J. Biochem. 164:485-506(1987).
  47. [ 2] Anderson B.F., Baker H.M., Norris G.E., Rice D.W., Baker E.N.
  48.      J. Mol. Biol. 209:711-734(1989).
  49.